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Genecards是一个什么样的数据库呢?
发布日期:2024-03-04 访问量:00000000
一、Genecards数据库简介

1.概念

Genecard是一个可搜索的集成人类基因组数据库,提供有关所有注释和预测的人类基因的全面、用户友好的信息。该知识库会自动集成来自约150个网络来源的以基因为中心的数据,包括基因组、转录组学、蛋白质组学、遗传、临床和功能信息。Genecards 的网址是:http://www.genecards.org/

2.应用价值

现在的医学研究,各个领域都能与基因关联。而要研究基因功能,首当其冲的就是要全方位了解基因信息,如基因与表型间的联系、基因互作蛋白分子、信号通路、临床意义等。而Genecards数据库作为检索人类基因信息的最优解,整合了众多文献信息,覆盖了多个数据库对于基因的分析数据,囊括了基因相关的任何信息。学会使用GeneCards,就掌握打开基因功能研究大门的第一把钥匙,可谓一理通,百理融。

二、Genecards数据库的使用

Genecards 的基因信息检索包括以下三种模式:

1、快速检索模式;

2、高级检索模式

3、基因检索模式

接下来,我们将以LAYN这个基因为例,逐一举例演示。

1.快速检索模式
快速检索模式包括“关键词“、”基因名“、”基因名/别名“、”基因名/别名/标识符“四种检索方式,这里以”关键词“为例进行演示。

在检索框中输入”LAYN“,然后点击检索按钮,即可获取到所有包含”LAYN“字眼的基因卡,也就是说,检索结果中不仅包含了”LAYN“基因本身,也包括了信息当中提到了”LAYN“的其他基因。

2.高级检索模式

点击“Advanced“进入高级检索模式后,我们会看到两个条件检索栏。这里仍然以检索” LAYN基因相关的lncRNA和假基因“为例。高级检索模式的检索策略与其他许多数据库的类似,即通过AND或OR连接不同级别的检索词,在Section中可以筛选期望检索词出现在哪一信息板块。而上方有一栏检索词会随着我们的输入和设置进行自动变换,方便我们更直观地查看自己的检索策略。
看到这里你可能已经发现,高级检索模式比快速检索模式更“高级“的功能即在于”检索模块“的限定上,所以当情况更为复杂时,就可以借助高级检索模式。

3.基因检索模式

这一检索模式更为简单直接,是以基因名称来直接检索。检索得到的界面如下图,其中基因卡的各栏目就是最核心的部分。

 

 

以上就是对Genecards数据库的介绍和使用指南,如果你有对基因信息检索的相关需求的话,就赶紧进入数据库实操试试看吧!